本文使用AmpFISTRSinofiler™(美国AB公司)系统对在广州地区居住的非洲籍人群122个无关个体样本进行15个STR基因座（FGA、vWA、CSF1PO、D3S1358、D5S818、D7S820、D8S1179、D13S317、D16S539、D18S51、D21S11、D2S1338、D19S433、D6S1043、D12S391)的检测，获得了上述15个基因座基因频率、偶合率、非父排除率等法医学应用基础数据，对涉及非洲籍人个体识别、亲权鉴定等提供基础数据，探讨了在广州居住的非洲籍人群与广州汉人遗传学差异，显示Snofiler检测系统在样本种群推断方面有应用价值。
1材料和方法1.1材料的采集
标本来自在广州居住的非洲籍人群中随机选取无关人员样本122份，其中男性样本104份，女性样本18份，共来自23个非洲国家(见表1)，样本种类包括血样与口腔拭子。
1.2方法
1. 2.1DNA的提取样本用TECAN®公司的Free-domEVO-150型全自动化工作站平台以磁珠法提取，磁珠提取采用北京东胜创新生物科技有限公司的EQ1000法医提取试剂盒。
1.2.2 PCR扩增使用AmpFLSTR®Sinofiler™PCRAmplificationKit荧光标记复合扩增试剂盒，GeneAmp9700型扩增仪上对所提取的DNA进行扩增，扩增体系为8jbtL，其中含PCRReactionMix3piL,引物1.8fxL,AmpliTaqGold™(5U/^L)0.25ML,模
表1122份样本所属国籍
所属国籍
样本数 尼日利亚52  加纳18 喀麦隆8 乌干达7 刚果5  利比亚4 几内亚3
 贝宁 坦桑尼亚  苏丹 南非 马里  尼日尔 安哥拉
样本数 3  3 3 3 2  2 2
 布隆迪  摩洛哥 中非共和国 肯尼亚 阿尔及利亚塞拉利昂   多哥
样本数 1  1 1 1 1  1 1
  表2 广州非洲籍人群(n=122)15个STR基因座等位基因频率分布      
D8S1179 基因座 VWA 基因座 D7S820 基因座 D2S1338 基因座 D19S433 基因座
等位基因 基因频率 等位基因 基因频率 等位基因 基因频率 等位基因 基因频率 等位基因 基因频率
9 0.8% 11 O.A% 7 0.8% 16 7.0% 9 0.4%
10 1.6% 13 1.2% 7.3 0.4% 17 7.8% 11 10.7%
11 6.6% 14 6.6% 8 21.3% 18 4.5% 12 13.1%
12 9.0% 15 24.2^ 9 11.9% 19 15.2% 12.2 3.1%
13 16.4% 16 25.8% 9.2 0.4% 20 6.6% 13 28.3%
14 36.9% 17 20.1% 10 34.4% 21 16.8% 13.2 4.9%
15 22-1% 18 12.3% 11 19.3% 22 17.6% 14 16.4%
16 5.3% 19 6.1% 12 9.8% 23 8.6% 14.2 5.3%
17 0.8% 20 1.6% 13 1.6% 24 7.8% 15 7.4%
18 0.4% 21 1.6%   25 5.7% 15.2 5.7%
      26 2.0% 16.2 4.1%
      27 0.4%  
D5S818 基因座 D13S317 基因座 D16S539 基因鹿 CSFIPO 基因座 D3S1358 基因座
等位基因 基因频率 等位基因 基因频率 等位基因 基因频率 等位基因 基因频率 等位基因 基因频率
7 0.4% 8 2.0% 7 0.4% 7 7.4% 12 0.4%
8 8.2% 9 1*6% 8 2.5^  2.5% 14 8.6%
9 1.6% 10 2.9% 9 21.7%  6.6% 15 27.9%
10 4.9% 11 29.9% 10 16.0% 10 28.7% 16 37.3%
11 22.5% 12 41.8% 11 27.9% 11 27.0% 17 22.5°/0
12 3L1% 13 16.8% 12 18.0% 12 23.4% 18 3.3%
13 29.5% 14 4.9% 13 10.7% 13 4.1%  
14 1.2%   14 2.5% 14 0.4%  
15 0.4%   15 0.4%    
D6S1043 基因座 D12S391 基因座 D21S11 基因座 D18S51 基因座 FGA 基因座
等位基因 基因频率 等位基因 基因频率 等位基因 基因频率 等位基因 基因频率 等位基因 基因频率
10 1.2% 14 0.8% 24.3 0.4% 10 0.4% 18 0.4%
11 11.5% 15 9.0% 25 0.4% 10.2 0.8% 18.2 1.6%
12 23.S% 16 7.8% 26 0.4% 11 0.8% 19 6.1%
13 8.6% 17 16.8% 27 4.1% 12 5.3% 19.2 0.4%
14 4.1% 17.1 0.4% 28 21.7% 13 5.7% 20 4.1%
15 6.1% 18 21.3^c 29 18.9% 13.2 1.2% 20.2 0.8%
16 4.1% 18.3 0.4% 30 14.8% 14 5.3% 21 13.5%
17 8.2% 19 16.8% 30.2 1.6% 14.2 0.8% 22 27.9%
18 12.7% 19.1 0.4% 31 10.2% 15 16.0% 23 12.3%
19 9.8% 19.3 0.4% 31.2 4.5% 16 18.0% 24 13.5%
20 7.0% 20 13.9% 32 4.1% 17 17.2% 25 6.6%
21 0.8% 21 4.1% 32.2 6.6% 18 8.2% 26 6.6%
23 0.4% 22 3.3% 33.2 4.9% 19 14.8% 27 3.3%
24 0.8% 23 2.9% 34 1.6% 20 3.7% 28 1.6%
25 0.8% 24 1.2% 34.2 0.4% 21 0.8% 29 0.4%
  25 0.4% 35 2.9% 22 0.8% 33.2 0.4%
    36 1.6%   48.2 0.4%
    37 0.4%    
    38 0.4%    
板DNA0.5ng〜lng。PCR扩增条件按照试剂盒标准程序进行。
1.2.3扩增片段的电泳与分型按照试剂盒标准方
法在ABI-3130xl全自动遗传分析仪上进行毛细管电泳。使用GeneMapperID3.2软件分析获得样本基因分型结果。
1.2.4数据处理各基因座的等位基因频率与单体型检出频率用PowerstatsV12软件进行统计学计算，Genopop3.4软件对结果进行Hardy-Weinberg平衡验证。用Arlequin3.01软件进行AMOVA分析，计算群体间遗传距离Rst值，并根据遗传距离Rst值用MEGA3.1软件绘制各群体之间的系统发生树。
2结果与讨论
2.1 15个STR基因座的遣传多态性
122例广州非洲籍无关个体15个STR基因座等位基因频率结果见表2。等位基因频率分布符合正态分布规律，经Hardy-Weinberg平衡验证，未发现偏离。
2.2统计学分析
使用PowerstatsV12.xls软件（美国promega公司)计算15个STR基因座在广州居住的非洲籍人群中的杂合度(H)、个人识别能力（DP)、非父排除率(PE)和多态信息总量(PIC)等群体遗传学参数，结果见表3。累积个体识别率=1—5.80147X10—18、累积非父排除率=1一8.6019X1CT8。
表3广州非洲籍人群(n=122)15个STR基因座
的统计学分析
基因座 H DP PE PIC
D8S1179 0.795 0.836 0.59 0.74
D21S11 0.836 0.965 0.668 0.86
D7S820 0.795 0.836 0.59 0.74
CSF1PO 0.795 0.836 0.59 0.74
D3S1358 0.656 0.883 0.363 0.68
D5S818 0.770 0.893 0.545 0.72
D13S317 0.762 0.847 0.531 0.66
D16S539 0.852 0.925 0.700 0.78
D2S1338 0.877 0.967 0.749 0.87
D19S433 0.828 0.954 0.652 0.83
vWA 0.795 0.934 0.590 0.78
D12S391 0.910 0.957 0.816 0.85
D18S51 0.934 0.960 0.866 0.86
D6S1043 0.852 0.967 0.700 0.87
FGA 0.828 0.954 0.652 0.84
累积个体识别率=1-5.80147E—18;累积非父排除率=1-8.6019E-08
2.3广州非洲藉人群与其它3个种群遣传距离及系统发生树
根据广州汉族人群[1]、索马里居民群体[2]、巴哈马群岛（NewProvidence)非裔混合群体[3]与本文群体的13个STR基因座（FGA、vWA、CSF1PO、
D3S1358、D5S818、D7S820、D8S1179、D13S317、D16S539、D18S51、D21S11、D2S1338、D19S433)信息，应用Arlequin3.01软件进行AMOVA分析，获得4个群体间的遗传距离（RST值)见表4。结果显示，居住于广州的非洲籍人群与广州汉族遗传距离最远(RST=0.03603)，与索马里居民群体距离其次(RST=0.01341)，与巴哈马群岛非裔混合群体间的遗传距离最近(RST=0.00123)。并根据遗传距离获得系统发生树(见图1)，显示居住在广州的非洲籍人群最接近非洲本地的混合群体，而与广州本地汉族差别最大。
表4广州居住的非洲籍人群与广州汉族、索马里居民群体、巴哈马群岛非裔混合群体间的遗传距离(RST)值
 广州本地汉族 广州非洲籍人群 巴哈马非裔群体 索马里居民
广州本地汉族 -0.00000   
广州非洲籍人群 0.03603 —0.00000  
巴哈马非裔群体 0.03055 0.00123 —0.00000 
索马里居民 0.03129 0.01341 0.00979 —0.00000
,_广州地区非
__洲籍人群
__^1巴哈马群岛非裔混合群体
-索马里当地居民群体
-广州本地汉族
I-1
0.005
图1居住在广州的非洲籍人群与广州汉族、索马里居民群体、巴哈马群岛非裔混合群体间的系统发生树
3讨论
随着对非经贸活动的增加，非洲籍人口前来广州工作、定居逐年增多，涉及非洲籍人员的各类刑事案件也随之增多，但是STR基因座多态性信息研究仍属空白，缺乏人群针对性，影响对广州居住的非洲籍人群鉴定结论的科学性与权威性，可能引起质疑。
本文对122例广州非洲籍无关个体的15个STR基因座信息进行了研究，发现Sinofiler荧光检测系统对广州非洲籍人群的累积个体识别率为1一5.80147X10_18，累积非父排除率为1—8.6019X10_8，较该系统对应广州本地人群的累积个体识别率（1一7.34X10_18)与累积非父排除率（1—1.23X10-6)w为高,其中Sinofiler系统新引人的D6S1043、D12S391两个基因座在本文群体中的DP、PE和PIC值分别达到0.967与0.957,0.700与0.816,0.87与0.85，符合Shriver等提出的标准评价。
其次，本文中的群体为同一人种的区域性混合群体，民族与地域构成相对复杂，通过本文的研究比较，其STR基因座数据在统计学上作为一类特殊群体既有别与非洲本地单一种群，更加区别于广州本地人群，而更加接近巴哈马群岛非裔混合群体。研究发现广州地区非洲籍人群与本地人群在一些基因座的某些特定等位基因存在较大差异，如:D8S1179中等位基因型14，在非洲籍人群与本地汉族基因频率分别为36.9%与17.78%；D21S11中等位基因型28，在非洲籍人群与本地汉族基因频率分别为21.7%与4.71%；D7S820中等位基因型8、9、9.3、10、11、11. 2、12、13，在非洲籍人群与本地汉族基因频率分别为21.3%、11.9%、0、34.4%,19.3%.0、9.8%、1.6%与0.06%、0.25%,13.66%、6.91%、0、17.02%、35.35%、22.63；D13S317中等位基因型12，在非洲籍人群与本地汉族基因频率分别为41.8%与13.70%。
综上所述，本文通过对广州地区非洲籍人群样本15个STR基因座进行分型检测，计算杂合度（H)、个人识别能力(DP)、非父排除率(PE)和多态信息总量(PIC)等群体遗传学参数，表明Sinofiler荧光检测系统完全适用于广州地区非洲籍人群的个体识别与亲权鉴定的需要，同时具有良好的人群区分度，应用该系统获得的STR分型数据在研究广州非籍人群与本地人群的群体差异以及不同群体间遗传距离时具有重要的参考意义。